作为日本文部省直属的国立研究型大学，日本综合研究院大学自1988年创立以来，始终秉持"尖端科研引领教育创新"的办学理念。该校突破传统大学架构，构建起独特的博士培养体系，与18所国家级科研机构形成深度合作网络。
涵盖国际日本研究、媒体社会文化等7个专业方向，重点开展跨文化比较研究。特色项目包括：
设置天体物理、核聚变科学等5个前沿领域，配备世界级研究设施：
| 研究科 | 特色实验室 | 年度科研经费 |
|---|---|---|
| 生命科学研究科 | 基因编辑中心 | 18亿日元 |
| 先导科学研究科 | 光子技术研究所 | 22亿日元 |
学生可在日本国立遗传学研究所、宇宙航空研究开发机构等18所合作机构开展课题研究，享受双重学术资源支持。这种"大学+研究所"的协同培养模式，使博士生能够：
针对优秀本科生开设的硕博连读项目，通过阶段性考核实现无缝衔接：
学校建立三大支持中心保障研究质量：
